倪挺，男，1977年生于江蘇省啟東市，博士，研究員，博士生導師。現任內蒙古大學生命科學學院及生物醫學研究院教授、副院長，復旦大學研究員。在Nature、Nature Methods、PNAS、PLoS Pathogens、Scientific Reports等國際期刊發表20余篇研究論文，獲7項授權中國專利。入選中組部第三批“青年千人”計劃和上海市“浦江人才計劃”。 　

教育經歷：

2007-2010年在美國杜克大學從事博士后研究；

2000-2006年碩博連讀于北京大學生命科學學院；

2000年獲北京大學生命科學學院學士學位。

工作經歷：

2010-2012年在美國國立衛生研究院(NIH)擔任助理研究員；

2012年起受聘為復旦大學生命科學學院教授；

2022年起受聘為內蒙古大學生命科學學院及（2023年）生物醫學研究院教授、副院長、博士生導師。

學術兼職：

1、擔任中國老年學和老年醫學學會老年病學分會衰老基礎醫學專家委員會副主任委員。

2、上海市遺傳學會副秘書長。

3、中國環境誘變劑學會暴露組學與暴露科學專業委員會常務委員等。

招生信息：

本實驗室注重實驗和分析的有機結合，歡迎分子生物學或生物信息學背景的學生報考碩士生和博士生。

培養研究生情況：

培養博士和碩士20余名。 

研究方向 ：

衰老及相關疾病的細胞分子機制

主要從事真核生物全基因組水平的基因表達調控研究。專攻通過高通量測序技術研究真核生物轉錄組的復雜性，特別是轉錄起始位點、反義轉錄體和多聚腺苷酸加尾位點的全基因組水平精確定位。在Nature Methods, Nature Protocols, PLoS Genetics, PLoS ONE等雜志發表多篇重要論文。申請13項中美專利，5項已獲授權。長遠目標：通過揭示和研究真核生物轉錄組的多樣性，了解高等生物基因調控網絡，并為深入理解人類疾病的復雜性提供理論依據。

Research Interests:

Developing high-throughput genomic methods for understanding transcriptome diversity. We are especially interested in how alternative promoter usage, antisense transcription and 3’-end formation contributes to transcriptome complexity.

承擔科研項目情況：

主持國家973計劃課題和國家重點研發計劃課題各一項，主持國家基金委重大研究計劃培育項目1項，主持國家基金委面上項目3項，參與國家973計劃/重點研發計劃課題2項，是基金委創新群體骨干成員。     

科研成果：

在Nature、Science、Nature Methods、Nature Communications、Genome Research（3篇）、Nucleic Acids Research（3篇）、Aging Cell（2篇）、Protein Cell等國際知名雜志發表50余篇SCI研究論文，成果被Nature Methods、Nature Reviews Genetics等評述。申請中美專利15項（7項獲授權）。長期致力于mRNA加工成熟的機制及生物學意義研究，聚焦mRNA非編碼區（內含子及3′非翻譯區）在細胞衰老及衰老相關疾病中的功能機制解析。建立了研究mRNA非編碼區的系列方法，揭示了疾病相關點突變及多個重要RNA結合蛋白通過改變mRNA非編碼區來調控細胞衰老及衰老相關疾病的分子機制，提出了動態變化的mRNA非編碼區調節細胞衰老的新觀點，拓展了mRNA非編碼區在衰老相關疾病中的生物學意義。

在Nature、Nature Methods、PNAS、PLoS Pathogens、Scientific Reports等國際期刊發表70余篇研究論文。

發表英文論文：（#共同一作，*共同通訊）：

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[68]Tang, MJ; Shen, Y; Hu, YL; Cao, L; Ni, T; Zhang, HY; Lin, ZP*.Allergenicity assay of allergen from Dermatophagoides farinae in transgenic tobacco.Chinese Science Bulletin, 2004, 49(5): 452-455.

[69]Hu, YL; Chen, BJ; Ni, T; Li, N; Li, Z*.Promoter of the rolC gene of Agrobacterium rhizogenes can be strongly regulated in glandular cell of transgenic tobacco.Molecular Biotechnology, 2003, 24(2): 121-125.  

[70]Guoliang Lyu#; Le Zong#; Chao Zhang; Xiaoke Huang; Wenbing Xie; Junnan Fang; Yiting Guan; Lijun Zhang; Ting Ni*; Jun Gu*; Wei Tao*. Metastasis-related methyltransferase Merm1 represses methyltransferase activity of Dnmt3a and facilitates RNA polymerase I transcriptional elongation.Journal of Molecular Cell Biology.

[71]Zhang, Yanyan; Bai, Qiang; Ni, Ting; Yang, Liuqing; Jiang, Lubin; Ye, Lilin; Wu, Yuzhang.The LncRNA Snhg1 is Essential for Memory CD8 T Cell Establishment.Annual Meeting of the American-Association-of-Immunologists - Immunology 2020, 2020-05-08 To 2020-05-12.

發表中文論文：

[1]吳好, 周小蘭, 倪挺, 游懷舟, 陳靖. 腎臟VDR表達與衰老密切相關-來自多個數據庫的綜合分析[J]. 老年醫學與保健, 2023, 29 (04): 779-784+788.

[2]倪挺. “基因轉錄調控的奧秘”微課教案[J]. 高校生物學教學研究(電子版), 2021, 11 (05): 3-4.

[3]曹君紅, 陳蒙, 賈琦, 趙昭昭, 文海梅, 姚鈞, 余鵬, 馬海靜, 倪挺, 魏剛. 剪接因子異質核糖核蛋白A2B1在癌細胞和衰老細胞中的相反表達趨勢及其對癌細胞衰老的調控（英文）[J]. 中國生物化學與分子生物學報, 2021, 37 (01): 66-75.

[4]宋逸釩, 倪挺, 魏剛. 小鼠精子發生中環形RNA生成和功能分析[J]. 生物信息學, 2020, 18 (01): 22-30.

[5]廉亞茹, 劉新華, 韓苗, 潘禮龍, 胡金鋒, 魏剛, 倪挺. p38-p53-p21信號通路參與調控血管緊張素-Ⅱ誘導的人血管平滑肌細胞衰老[J]. 復旦學報(自然科學版), 2015, 54 (06): 768-777+785.

[6]陳堅, 胡鳶雷, 周朝富, 倪挺, 林忠平. 葡萄糖氧化酶基因對桉樹的遺傳轉化[J]. 林業實用技術, 2007, (06): 3-4.

[7]賈煒瓏,楊麗莉,張彥芹,胡鳶雷,倪挺,吳锜,林忠平. 紫羊茅高頻植株再生系統的建立與GUS基因的轉化[J]. 草業學報, 2005, (04): 53-58.

[8]吳錡,胡鳶雷,倪挺,賈煒瓏,林忠平. 轉基因草坪草的研究概況與展望[J]. 草業科學, 2004, (01): 29-34+70.

[9]唐明娟,胡鳶雷,曹蕾,申業,倪挺,張宏譽,林忠平. 粉塵螨過敏原在轉基因植物中的致敏活性分析[J]. 科學通報, 2004, (01): 86-89.

[10]倪挺,胡鳶雷,林忠平,李宏,張宏譽,彭于發,董志峰. 轉基因產品致敏性評估的規范化[J]. 中國農業科學, 2002, (10): 1192-1196.

[11]林忠平,倪挺. 轉基因食品的過敏特性評估——食物過敏原數據庫的建立[J]. 生物技術通報, 2001, (06): 46-47.

[12]倪挺,李宏,胡鳶雷,高音,張宏譽,林忠平. 食物過敏原數據庫的建立和使用[J]. 科學通報, 2000, (14): 1567-1568.

發表會議論文：

[1]倪挺, 胡鳶雷 &  林忠平. (2006). 表達人胰島素基因的轉基因靈芝. (eds.) 中國生物工程學會2006年學術年會暨全國生物反應器學術研討會論文摘要集 (pp.42).  

[2]倪挺, 胡鳶雷, 林忠平, 李宏 &  張宏譽. (2002). 轉基因產品過敏性評估的規范化. (eds.) 21世紀作物科技與生產發展學術討論會論文集 (pp.92-98).

獲獎情況 (Awards)：

1、2012年入選中組部青年**計劃(第三批)。

Recruitment Program of Global Experts (1000 plan)

2、上海市“浦江人才計劃”。

3、曾獲2020年全國高校生命科學類微課教學比賽一等獎。

 

學術交流：

資料更新中……

1 倪挺:探索基因調控之復雜 徐芳芳 科學中國人 2015-12-01 特色期刊

2 人體細胞衰老研究取得新進展 中國科技投資 2013-05-20 期刊

3 走在基因研究探索之路上——記復旦大學生命科學學院研究員倪挺 郭洋 海峽科技與產業 2013-04-15 期刊

4 倪挺:立足“中心法則” 期待夢照現實 江楓 中國發明與專利 2012-10-16 期刊

從1909年丹麥遺傳學家約翰遜在《精密遺傳學原理》一書中正式提出“基因”概念，以此來替代孟德爾假定的“遺傳因子”。“基因”一詞便伴隨著遺傳學發展至今。 　　　

在神奇的生命世界里，科學家們尋找到這樣一條所有細胞結構生物都遵循的“中心法則”，即遺傳信息通過轉錄從DNA（脫氧核糖核酸）到RNA（核糖核酸），再通過翻譯從RNA到蛋白質。 　　　

圍繞這一“中心法則”，許多科學家對生命體的各個環節進行了深入的探尋，復旦大學生命科學學院倪挺研究員就是其中一員。近年來，倪挺因在基因表達最重要的調控手段之一——中心法則中的“轉錄”和衰老相關疾病的轉錄組復雜性等方面有了新的進展，在國際上受到了廣泛認可。 　　 　　　

生命科學之“夢” 　　 　　　

“通過揭示和研究真核生物轉錄組的多樣性，了解高等生物基因調控網絡，并為深入理解人類疾病的復雜性提供理論依據。”這是倪挺從事生命科學研究以來一直堅持的夢想。朝著這一目標，他用自己對生命科學的熱情一路求索、追尋，留下了精彩的足跡。 　　　

愛因斯坦說，興趣是最好的老師。倪挺也說：“他和基因學有緣。”從小他就對生命世界充滿了好奇，探索和求知的欲望使他慢慢推開了生命科學的大門。那時的他還不知道，門外，就是他的夢想。 　　　

1996年，倪挺以優異的成績考入北京大學生命科學學院生物化學及分子生物學系。未名湖畔，博雅塔下，恰同學少年，風華正茂，在濃厚的學習氛圍的熏陶下，他開啟了生命科學之旅。從生物化學及分子生物學系學士學位到碩博連讀植物學博士學位，10年的寒窗苦讀，執著于夢想的他從未在探索生命科學領域的道路上停止過。 　　　

在生命科學植物分子生物學研究領域耕耘的林忠平教授的耐心指導下，倪挺對生命科學的理解逐漸由表及里，由淺入深。除了逐漸牢固生物研究基礎知識之外，他開始在研究方法、研究手段上有所精進，形成了自有的研究哲學和風格。 　　　

在碩博連讀期間，他就建立了中國第一個食物及花粉過敏原數據庫（http://ambl.pku.edu.cn），被農業部指定為轉基因食品安全過敏性評估專業機構，獲得了北京大學最具份量的創新獎。同時，他還利用轉基因技術獲得了高表達小胰島素原類似物的轉基因靈芝，并證實口服轉基因靈芝可以顯著降低實驗動物的高血糖，研究成果對于口服胰島素的應用具有重要意義。 　　　

"科學探索永無止盡”，對倪挺來說更是如此。在北京大學博士畢業以后，他懷抱進一步深造的夢想，馬不停蹄地跨出國門，開啟了學術研究上的另一段重要征程。2007年～2010年進入美國杜克大學基因組科學與政策研究所在朱鈞教授實驗室從事博士后研究，2010年～2012年在美國國立衛生研究院（NIH）擔任助理研究員。 　　　

5年的海外漂泊使倪挺有機會領略了國際最前沿的科研理念，煉就了洞察生命科學國際走向的“火眼金睛”。2012年，在國家緊缺創新型人才的時候，“羽翼豐滿”的倪挺借第三批“青年**計劃”的“東風”回到了祖國，受聘為復旦大學生命科學學院研究員。 　　　

“我們要把人生變成一個科學的夢，然后，再把夢變成現實。”居里夫人說過的這句話用來形容倪挺再適用不過，他也希望有“夢照現實”的一天。不管前面的路是平坦還是布滿荊棘，只要選擇了遠方，便只顧風雨兼程。正因為對生命科學的這份熱情與執著，他收獲了科研上的累累碩果。 　　 　　　

三項技術探秘基因表達調控 　　 　　　

隨著高通量測序技術的飛速發展，人們對于轉錄組的認識也不斷加深，許多新的剪接異構體、非編碼RNA以及新的調控方式不斷被發現，組成了一個神奇的RNA世界，也成為了一個新興的熱門領域。 　　　

在朱鈞博士實驗室，倪挺就接受了嚴格的現代分子生物學、細胞生物學以及基因組實驗技術的訓練，并且發展了新的多個基因組及轉錄組測序方法。他采用“分子條形碼技術”，使得新一代測序技術中最具挑戰性的序列較短的問題得以解決。該方法同時還能應用于白血病相關致病基因的早期低豐度突變的靈敏檢測，目前，已申請了美國發明專利。 　　　

轉錄是基因表達關鍵的第一步。倪挺針對轉錄的三個環節，開發了三種新的高通量測序方法，這三項成果成為其研究生涯中的三大亮點。 　　　

針對轉錄起始環節，倪挺開發了雙端測序方法，并首次在果蠅中發現三種轉錄起始模式，建立了其與啟動子核心元件及表觀遺傳標記的關聯性，從而豐富了對轉錄起始模式的認識。該技術同時為mRNA重新加帽（recapping）這一新現象提供了最為有力的證據，證明其廣泛存在于轉錄組中。由于這一工作的重要性，Nature Reviews Genetics在論述轉錄組復雜性時還特別引用了他們的這一發現。 　　　

雙端測序確定轉錄起始位點的方法發表于《Nature Methods》并被列為封面推薦。《Nature Methods》還以NEWS and VIEWS形式對倪挺的方法以及稍后時間發表的另一個相關方法進行了深度評述，并認為他們建立的方法極大地促進了轉錄起始位點研究。 　　　

隨后，《Nature Reviews Genetics》將他的這個方法作為RNA測序領域的一種重要方法給予介紹。論文同時被“基因組在線”這個在基因組研究領域具有重要影響力的網站在This week in Nature專欄中作為Nature Methods的唯一入選論文加以報道。這一方法同時也被介紹下一代測序技術的專著引用。關于轉錄起始模式和表觀遺傳學標記關聯的發現也被Nature Reviews Genetics作為重要文獻引用。 　　　

為了更好地從全基因組水平研究轉錄過程的調控，倪挺開發了定向連接介導的鏈特異性RNA-seq方法。利用這個方法，他首次在裂殖酵母中發現反義RNA富集在減數分裂和對環境脅迫應答的基因中，從而拓展了反義RNA新的生物學功能，豐富了人們對于真核生物轉錄調控復雜性的認識。 　　　

這是首次在單細胞生物中發現反義RNA參與了減數分裂這一與酵母生殖密切相關的重要過程。這一重要發現被隨后的Science封面文章多次引用并加以證實。同時，該方法已被國內外10多個實驗室采用并取得了很有意思的發現。 　　　

針對轉錄終止環節過程，倪挺建立了多聚腺苷酸精確定位測序方法（PA-seq）。這一方法的建立完善了對于轉錄過程從頭到尾的研究，為研究選擇性多聚腺苷酸化在基因調控中的重要作用提供了技術支撐。利用這個方法，他們測定了多個人體組織的polyA加尾位點，并取得了兩個很有意思的發現。其一，選擇性polyA加尾不僅在編碼基因中存在，在非編碼基因中也廣泛存在；其二，發現了一組對人組織特異性具有調控作用的選擇性Poly（A）新位點。 　　　

三項技術成果的組合使用對于全面理解和揭示真核生物轉錄組的復雜性，了解高等生物基因調控奠定了方法學基礎，為深入理解人類疾病的復雜性提供了全新手段。 　　 　　　

研發線粒體DNA低頻突變深度測序方法 　　 　　　

近10年來，衰老相關疾病顯著增加，而且一些疾病逐漸呈年輕化發展。衰老是一個漸進的緩慢過程，其必然包括某些基因成千上萬個拷貝的漸進性序列改變，而哺乳動物細胞中，只有線粒體這個遺傳系統有上千拷貝，從0～100％漸進的遺傳變異。 　　　

線粒體DNA(mtDNA)是母系遺傳，并有較大的遺傳變異，這些遺傳變異是使得人類能夠適應環境改變的一個重要因素。每個細胞含有百計的線粒體和千計的線粒體DNA(mtDNA)，研究表明，線粒體功能衰退和mtDNA的損傷被認為在衰老及其相關疾病中起著重要的作用，也和諸多疾病，如耳聾、心臟病、腎病等退行性疾病有關系。近幾十年來，研究者們提出各種衰老假說，并不斷聚焦于線粒體。隨著mtDNA分子生物學研究的深入，mtDNA在疾病中的作用逐漸為人們所重視。 　　　

在以前的研究中，由于檢測技術的限制，多數研究關注與mtDNA的缺失突變和高頻點突變導致的生物學后果，而對低頻點突變導致衰老及相關疾病的研究不足，特別是總體而言，mtDNA突變到什么程度才能引起衰老更是知之寥寥。 　　　

回答mtDNA突變（特別是低頻點突變）與衰老研究中的未解之謎，可靠測定線粒體低頻點突變的技術是前提。隨著高通量測序技術的飛速發展，測序的深度和覆蓋度不斷加深，使得之前所不能實現的低頻點突變檢測有了可能。 　　　

然而，近幾年出現的基于深度測序來測定線粒體突變的方法都存在一定的局限性：從細胞中分離線粒體，再提取線粒體DNA并構建文庫進行深度測序的方法涉及到線粒體的分離，操作復雜繁瑣，工作量大；基于聚合酶鏈式反應（PCR）擴增的深度測序方法覆蓋度均一性較差，易于引入低頻突變，干擾真正低頻突變的檢測；序列捕獲方法不能有效區分來自核基因組的線粒體假基因。 　　　

為了克服以上方法的缺點，倪挺及其科研團隊研發出了一種更簡單、更高效的線粒體DNA低頻突變深度測序方法。這種方法通過設計一組線粒體DNA特異的引物，采用滾環復制（RCA）從總DNA中富集線粒體DNA，并通過特定的限制性內切酶進一步富集線粒體DNA，然后構建測序文庫并進行高通量測序，并開發特定的數據分析流程，從而達到測定線粒體基因組中低頻率變異的目的。 　　　

RCA比PCR保真性大大增強，酶切過程克服了核基因組線粒體假基因的干擾。這兩方面的優勢使得倪挺研發的新技術能夠可靠檢測低至0.3％的mtDNA低頻點突變。這一精度足夠倪挺所在的科研團隊檢測頻率＜2％的點突變，因此突破了技術限制，為解決mtDNA低頻突變與衰老研究之間的關系提供了新的可能。 　　　

基于這一檢測方法，倪挺及團隊在線粒體DNA聚合酶g(Polg)基因突變導致mtDNA復制修復功能缺失的小鼠中進行了驗證，發現突變小鼠的mtDNA低頻點突變顯著高于野生型小鼠，并發現不同組織具有不同數目的低頻點突變，mtDNA聚合酶(Plog)基因突變導致早衰的小鼠中mtDNA突變水平的升高主要是由于低頻點突變的位點數目增加，而已有突變位點的頻率增加則居次要地位。更有意思的是，Polg基因突變小鼠中有更多的胞嘧啶(C)變成胸腺嘧啶(T)，使得更多親水氨基酸變成疏水性，提示低頻點突變的累積可能是導致早衰表型的原因。 　　　

在科研的不斷深入的同時，倪挺帶領科研團隊申請到了國家自然科學基金面上項目，在接下來的研究中，他將以“線粒體DNA低頻點突變在衰老中的影響及機制”為研究重點，利用自主開發的線粒體DNA低頻點突變檢測新方法，以具有早衰表型的小鼠和正常衰老的小鼠為研究對象，結合最新的基因編輯技術（實現基因定點突變）、鏈特異性 RNA-seq技術（研究線粒體DNA低頻點突變的基因表達）以及其他必要的分子生物學手段，闡明線粒體DNA低頻點突變在不同衰老類型中隨衰老進程的變化規律以及mtDNA在不同組織具有不同突變頻率/速度的內在機制。 　　　

目前，為了能夠深入研究這一課題，倪挺組織力量進一步加強實驗和生物信息學的結合，解讀線粒體基因及核基因組所攜帶的遺傳信息傳遞過程，探索生命這個復雜系統的奧秘。與此同時，他也一直在為煉就一支精于科研的團隊，為生命科學培養出更多的精英，研發新技術而忙碌。 　　　

對于未來的規劃，倪挺心中已再清晰不過了。站在黃浦江畔，立身于復旦這所在學術研究上享譽全球的巍巍大學，倪挺用科研成果詮釋著自己對生命科學的熱情與執著。 　　 　　　

專家簡介： 　　 　　　

倪挺，1977年生于江蘇省啟東市，復旦大學生命科學學院教授、博士生導師。主要借助高通量測序技術及現代分子生物學等手段研究真核生物轉錄組的復雜性以及細胞衰老基因表達調控的分子機制。在Nature、Nature Methods、PNAS、PLoS Pathogens、Scientific Reports等國際期刊發表20余篇研究論文，獲7項授權中國專利。入選中組部第三批“青年千人”計劃和上海市“浦江人才計劃”。擔任國家科技部“973計劃”課題負責人和科技部重大科學研究計劃研究骨干，主持兩項國家自然科學基金面上項目，是國家自然科學基金委創新研究群體的研究骨干。 　

      來源：科學中國人  2015年12期 封二人物
 

解讀基因“密碼” 探索生命奧秘

 

從1909年丹麥遺傳學家約翰遜在《精密遺傳學原理》一書中提出“基因”概念，以此來替代孟德爾假定的“遺傳因子”以來，“基因”一詞一直伴隨著遺傳學發展至今。100多年來在科學家們長期不懈地努力下，逐漸揭開了人類生命活動基本過程的面紗。隨著高通量測序技術(下一代測序技術)的飛速發展，人們對于基因組及轉錄組的認識也不斷加深，許多新的剪接異構體、非編碼RNA以及新的調控方式不斷被發現，組成了一個神奇的RNA(核糖核酸)世界，也成為了一個新興的熱門領域。從全基因組的角度全面理解真核生物轉錄組的復雜調控對于揭示人類重大疾病的病因及復雜性具有重要意義。

倪挺，復旦大學生命科學學院研究員，中組部“青年**計劃”(第三批)入選者，青年歸國學者。主要從事真核生物全基因組水平的基因表達調控研究。

“中心法則”是指遺傳信息通過轉錄從DNA(脫氧核糖核酸)到RNA，再通過翻譯從RNA到蛋白質。近年來，倪挺在基因表達最重要的調控手段之一 ——“中心法則”中的轉錄這一環節上，不斷取得重要的發現和突破，廣受國內外學界的關注。

針對轉錄起始環節方面，倪挺開發了轉錄起始位點雙端測序方法，并首次在果蠅中發現三種轉錄起始模式，建立了其與啟動子核心元件及表觀遺傳標記的關聯性，從而豐富了對轉錄起始模式的認識。該技術同時為mRNA重新加帽(recapping)這一新現象提供了最為有力的證據，證明其廣泛存在于轉錄組中。同以往的方法相比，他的方法除了更精確和特異外，還彌補了之前方法不能檢測轉錄體下游基因結構的不足。同時這一成果為表觀遺傳學的研究提供了最為細致和精確的基礎數據。

這一方法不久前發表于Nature Methods并被列為封面推薦。Nature Methods還以NEWS and VIEWS形式對倪挺的方法以及稍后時間發表的另一個相關方法進行了深度評述，并認為他們建立的方法極大地促進了轉錄起始位點研究。隨后，Nature Reviews Genetics將他的這個方法作為RNA測序領域的一種重要方法給予介紹。論文同時被“基因組在線”這個在基因組研究領域具有重要影響力的網站在This week in Nature專欄中作為Nature Methods的唯一入選論文加以報道。這一方法同時也被介紹下一代測序技術的專著引用。關于轉錄起始模式和表觀遺傳學標記關聯的發現也被Nature Reviews Genetics作為重要文獻引用。

利用這個方法，倪挺及同事首次在果蠅中發現信使RNA(mRNA)重加帽現象。在果蠅中發現這一現象的好處是果蠅作為重要模式生物，遺傳背景比較清楚，有眾多的基因敲除品系，可以很好地研究其分子機制，從而為理解信使RNA重加帽這一新現象鋪平了道路。在他們的論文發表后不久，多個該領域著名實驗室相繼報道了這一現象。由于這一工作的重要性，Nature Reviews Genetics在論述轉錄組復雜性時還特別引用了他們的這一發現。

針對轉錄過程的調控方面，倪挺開發了針對這一過程的全基因組反義轉錄體測定方法。利用這個方法，首次在裂殖酵母中發現反義轉錄體富集在減數分裂和對環境脅迫應答的基因中，從而拓展了反義轉錄體新的生物學功能。

反義轉錄體是指與正義基因有反向重疊的轉錄體，通常正義基因編碼蛋白，而反義轉錄體不編碼蛋白。已有的研究已經發現反義轉錄體具有重要的生物學功能，比如參與X染色體失活、印記基因、能控制酵母細胞命運以及引起地中海貧血。這是首次在單細胞生物中發現反義轉錄體參與了減數分裂這一與酵母生殖密切相關的重要過程。 這一重要發現被隨后的Science封面文章多次引用并加以證實。同時該方法已被國內外十多個實驗室采用并取得了有意義的發現。

最近，倪挺在學術上又取得了重要的進展，建立了針對轉錄終止環節的多聚腺苷酸(polyA)定位測序技術。這一方法的建立完善了對于轉錄從頭到尾的研究。利用這個方法，他們測定了多個人體組織的polyA加尾位點，并取得了兩個很有意思的發現。其一，選擇性polyA加尾不僅在編碼基因中存在，在非編碼基因中也廣泛存在;其二，發現了一組對人組織特異性具有調控作用的選擇性Poly(A)新位點。

倪挺針對基因轉錄從頭到尾的三個重要調控環節，建立了三種新的測序方法，取得了系列重要發現，可以預想，這三個技術的組合使用對于全面理解和揭示真核生物轉錄組的復雜性，了解高等生物基因調控網絡具有重要作用，并將為深入理解人類疾病的復雜性提供理論依據。倪挺的科研下一階段一方面會向“中心法則”下游翻譯環節進行拓展，另一方面將對癌癥和衰老相關疾病的轉錄組復雜性進行深入研究。

來源：《中國科學報》 (2012-11-08 9 專題)  
 

走在基因研究探索之路上

——記復旦大學生命科學學院研究員倪挺 　

來源：《海峽科技與產業》2013年 第4期