我國肉牛功能基因組學(xué)研究取得新進(jìn)展

日期：2015年09月02日 來源：科技部

我國是世界上牛品種資源最為豐富的國家，秦川牛、魯西牛等地方牛品種（系）代表了我國優(yōu)良的牛品種（系）。為進(jìn)一步挖掘我國地方黃牛優(yōu)異種質(zhì)資源，解析重要經(jīng)濟(jì)性狀形成的分子機(jī)制，加快我國特色優(yōu)異肉牛新品種選育進(jìn)程，2013年科技部863計(jì)劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域啟動(dòng)了“中國肉牛重要經(jīng)濟(jì)性狀功能基因組學(xué)研究”課題，近日科技部863計(jì)劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域辦，組織有關(guān)專家對“中國肉牛重要經(jīng)濟(jì)性狀功能基因組學(xué)研究”課題進(jìn)行了中期檢查。

“中國肉牛重要經(jīng)濟(jì)性狀功能基因組學(xué)研究”課題自2013年啟動(dòng)以來，課題組利用基因組重測序等功能基因組學(xué)方法，對秦川牛肉用新品系、魯西牛、南陽牛、延邊牛、雷瓊牛、云南黃牛、大額牛等8個(gè)地方牛品種（系）及黑毛和牛、紅安格斯牛等2個(gè)國外培育肉牛品種共88個(gè)樣本進(jìn)行了基因組解析，獲得了51.86M SNPs和4.82Mindel，進(jìn)而從基因組水平揭示了我國地方黃牛品種在8000年的演化歷史中，明顯受到了瘤牛血統(tǒng)的影響。同時(shí)，通過比較基因組學(xué)分析，課題組發(fā)現(xiàn)：相比國外肉牛品種，以秦川牛為代表的地方黃牛在長期馴化過程中，以SPTBN5為代表的免疫應(yīng)答相關(guān)基因得到了明顯正選擇，這很好的解釋了我國地方黃牛抗逆性狀的形成機(jī)制；以BBS2和LTA4H等為代表的與脂代謝和肌肉發(fā)育相關(guān)的基因在和牛中受到強(qiáng)烈選擇，表明黑毛和牛肉用性能在長期選育過程中得到明顯提高。此外，課題組還完成了15頭野生牦牛和65頭家養(yǎng)牦牛5X基因組覆蓋度重測序，新鑒定SNP 714萬個(gè)，在1910個(gè)可能受人工選擇區(qū)域中，80%定位到了黃牛中已經(jīng)識(shí)別的產(chǎn)肉、產(chǎn)奶等QTL上。上述研究為我國地方黃牛肉用選育改良、分子育種及牦牛的DNA標(biāo)記輔助選擇育種研究提供重要依據(jù)，奠定了良好基礎(chǔ)。

中期檢查期間，專家組認(rèn)真聽取了課題匯報(bào)，審閱了相關(guān)資料，考察了課題實(shí)施現(xiàn)場，專家組一致認(rèn)為“中國肉牛重要經(jīng)濟(jì)性狀功能基因組學(xué)研究”課題研究思路清晰、方法得當(dāng)，取得了重要階段性成果，為完成課題任務(wù)目標(biāo)奠定了良好基礎(chǔ)。同時(shí)，專家組建議課題進(jìn)一步凝練研究方向，加強(qiáng)對具有重大應(yīng)用潛能的基因和SNPs的深入研究，并在功能研究的基礎(chǔ)上，推進(jìn)這些基因和分子標(biāo)記在肉牛生產(chǎn)上的應(yīng)用。